Après avoir publié une liste des applications que j'utilise sur Android, voici une petite sélection de ce que j'ai sur ordinateur.
Évidemment, ce ne sont que des applications libres : elles sont disponibles sur Linux et quand je les utilises sous Windows, je fais en sorte qu'elles soient libres (pour mon usage personnel - professionnel c'est autre chose).

Pour, à la fois Windows et Linux

• Gimp (W) :
  Le PhotoShop-like par excellence. Logiciel très mature, très bien fini, bourrés de fonctions très utiles (mais parfois difficilement accessible pour le néophyte) et qu'il est possible de compléter avec des plugins.
• Hugin (W) :
  Permet de créer des panoramas. Pratique pour certains usages spécifiques. Je ne l'utilise pas tous les matins mais quand j'en ai besoin, je le trouve très performant.
• Filezilla (W) :
  Permet de gérer des fichiers en FTP. L'interface n'est pas extraordinaire mais remplie très bien sa fonction et permet de petits ajustements pratiques.
• Pidgin (W) :
  Le couteau-suisse de la messagerie instantanée. Je n'ai pas réussi à l'utiliser sur ma récente installation de Xubuntu mais globalement il est assez efficace.
• Firefox (W) :
  On ne le présente plus. Malgré son poids, est devenu mon compagnon de navigation depuis des années. Je fais attention à ne pas trop le charger en plugin ce qui est, je crois, une cause de ralentissement qu'un certain nombre de personnes constate.
  J'ai écris un shaarlink avec ma config' et mes astuces pour Firefox.
• VLC (W) :
  Autre logiciel incontournable. Ses fonctionnalités sont très nombreuses et malgré son poids il demeure très très pratique.
• Assault Cube (W) :
  Le seul jeu libre auquel j'ai vraiment joué. C'est un FPS, jouable en ligne. Un peu vieillot mais reste efficace.
• Frets on Fire (W) :
  Celui-ci j'adore ; c'est comme Guitar Hero mais à la place d'une fausse guitare, on utilise son clavier pour jouer les notes : très amusant. Malheureusement le développement a été stoppé et trouver d'autres pistes que les 3 incluses n'est pas évident mais ça promet des soirées entre amis très sympa.
• Meld (W) :
  Logiciel multiplateforme pour faire de la comparaison de répertoire ou de fichiers, très pratique. Juste un problème sur la taille de la fenêtre et quelques options d'ergonomie qui sont absentes mais ce logiciel fonctionne bien.
• Inkscape (W) :
  Pour créer et éditer des images vectorielles. Gère aussi (un peu) les *.pdf. J'en ai peu d'usages mais il me semble indispensable néanmoins.

Sur Linux uniquement

• Youtube-dl (W) :
  Pour télécharger des vidéos de différentes plateformes.
  Utilisation en CLI uniquement.
• Clipgrab (W) :
  Identique à Youtube-dl mais permet une gestion en parallèle et possède une interface graphique.
• jpegtran (W) :
  Permet de transformer des photos en lot.
  Utilisation en CLI uniquement.
• Phatch (W) :
  Identique à jpegtran mais avec une interface graphique. Contraction de batch et photos.
• cheat (W) :
  Pour avoir des suggestions de commandes en plus de l'aide fournie par man. Utilisation en CLI uniquement.

Sous Windows uniquement

• 7-zip (W) :
  On ne le présente plus, c'est le logiciel le plus intéressant pour compresser/archiver des dossiers/fichiers.
• Process Explorer (W) :
  Pour surveilles les processus qui tourne.
• Greenshot (W) :
  Facilite la capture d'écran et l'édition desdites captures.
• Dexpot (W) :
  Permet la gestion (virtuelle) de plusieurs bureau, sur plusieurs écrans. Et petit bonus, il est possible avec de configurer un fond d'écran différent pour chaque écran.
• Q-dir (W) :
  Un simple explorateur de fichiers mais avec une gestion de l'affichage plus poussées : par exemple on peut avoir de une scission de l'écran ou alors des onglets.
• Notepad++ (W) :
  L'éditeur de fichiers par excellence que l'on ne présente plus. Dommage qu'il n'existe pas sous Linux (pourtant il est sous licence libre...)
• SumatraPDF (W) : Lecteur de fichiers *.pdf très léger et assez tolérant sur les formats. Ne permet malheureusement pas l'édition.
• F.lux (W) :
  Assez déroutant mais permet de réguler la température de l'écran en fonction de l'heure du jour et la position sur la Terre. Cela permet de réduire la fatigue visuelle et aussi de faire comprendre au cerveau que c'est la nuit et donc à avoir un meilleur sommeil en général.
• PNotes (W) :
  Permet de prendre des notes.
• Windirstat (W) :
  Très pratique pour voir l'usage en termes d'espace d'un disque ou d'un dossier en particulier.
• Deskpins (W) :
  Application pour conserver une fenêtre en particulier au-dessus des autres ; par exemple la calculatrice ou un éditeur de texte pour prendre des notes en naviguant sur Internet.

Pour info, il y a ailleurs sur internet des listes de suggestions d'installation :

• La check-list d'installation de Timo - pour Linux-Mint mais c'est évidemment transposable à tout autre *-nux;
• La customisation de sebsauvage - pour Linux-Mint encore mais c'est assez générique ;
• Le site de la-vache-libre - pleins d'articles sur des logiciels découverts ;
• Le démarrage avec Debian-facile - pour démarrer avec LXDE.